Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nubp2Q9R061 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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