Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atp11cQ9QZW0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms