Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms