Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms