Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a3Q9QZB6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms