Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps29Q9QZ88 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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