Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx4Q9QY61 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms