Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxe3Q9QY14 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms