Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms