Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rad18Q9QXK2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms