Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms