Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms