Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CubnQ9JLB4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms