Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms