Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ap3m1Q9JKC8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms