Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK24

Ppp2r3c, Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r3cQ9JK24 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r3cQ9JK24 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r3cQ9JK24 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms