Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms