Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efcc1Q9JJF6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms