Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a3Q9JHW9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms