Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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