Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx12Q9ER00 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms