Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rapgef4Q9EQZ6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rapgef4Q9EQZ6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rapgef4Q9EQZ6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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