Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms