Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms