Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms