Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf225Q9D7D1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms