Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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