Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms