Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms