Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim42Q9D2H5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms