Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Mrpl28Q9D1B9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Mrpl28Q9D1B9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Mrpl28Q9D1B9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Mrpl28Q9D1B9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Mrpl28Q9D1B9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Mrpl28Q9D1B9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Mrpl28Q9D1B9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Mrpl28Q9D1B9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Mrpl28Q9D1B9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Mrpl28Q9D1B9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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