Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms