Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc17Q9CXD9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms