Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms