Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930519P11RikQ9CUJ8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms