Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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