Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms