Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubl4bQ9CQ84 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubl4bQ9CQ84 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms