Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnaseh2cQ9CQ18 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnaseh2cQ9CQ18 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnaseh2cQ9CQ18 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnaseh2cQ9CQ18 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnaseh2cQ9CQ18 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnaseh2cQ9CQ18 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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