Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms