Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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