Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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