Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clp1Q99LI9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms