Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clcc1Q99LI2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clcc1Q99LI2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clcc1Q99LI2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clcc1Q99LI2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clcc1Q99LI2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clcc1Q99LI2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Clcc1Q99LI2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Clcc1Q99LI2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Clcc1Q99LI2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Clcc1Q99LI2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcc1Q99LI2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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