Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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