Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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