Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hps4Q99KG7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps4Q99KG7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms