Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdxdc1Q99K01 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms