Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd6Q99JI4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms