Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Sfxn4Q925N1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Sfxn4Q925N1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Sfxn4Q925N1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Sfxn4Q925N1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Sfxn4Q925N1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Sfxn4Q925N1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sfxn4Q925N1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sfxn4Q925N1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sfxn4Q925N1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms